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“生物医药网络文献挖掘系统及其应用”培训通知

导读
时间:2015-12-18
地点:广州天河区龙口东路龙口科技大厦3楼会议室

    广州生物医药公共服务平台为帮助广大科研工作者更好地了解生物医药网络文献挖掘系统的应用,特邀南方医科大学肿瘤研究所的汪佳宏博士精心设计了“文献挖掘系统及其应用”的课程,免费培训。

背景介绍

    用高通量筛选方法(基因芯片、蛋白质组学等)筛选差异表达基因之后,利用软件或者数据库解析这些差异表达基因的功能、参与的生物学过程、调控通路,并构建蛋白质相互作用网络等一系列步骤,已经成为探索疾病的发病机理和分子机制的常规方法。但目前人工注释数据库注释的基因功能和分子相互作用存在数量不够多、范围不够广等问题。为解决这些问题,广州生物医药公共服务平台与南方医科大学黄仲曦团队联合开发了生物医药网络文献挖掘系统。  

    该系统可以直接从文献中获取信息,是解析基因、识别分子相互作用、检索关键词相关基因的有效工具。可通过PubMed摘要的文献信息注释基因功能、构建分子网络、检索相关基因。包括两个工具软件:GenCLiP 2.0用来注释基因功能、构建分子网络;CooLGeN用来检索任意关键词相关基因。点击查看更多文献挖掘系统介绍

目前,广州生物医药公共服务平台用户可免费使用该系统开展相关研究。

培训内容

    1、文献挖掘系统原理及功能讲解;

    2、学习利用GenCLiP 2.0软件分析一组人基因富集的关键词并构建分子互作网       络。

    (进入GenCLiP 2.0界面:http://www.gzbio.net/gen/)

    3、学习利用CooLGeN软件检索与任意词汇和基因一同在文献中出现的基因,以及     构建这些基因的基因网络。

   (进入CooLGeN界面: http://ci.smu.edu.cn/CooLGeN/)

主讲人

    南方医科大学肿瘤研究所   汪佳宏   博士

    主要研究方向:1、基于高通量组学数据的分子网络研究和药物筛选;2、文献挖     掘研究。

培训时间及地点

    时间:2015年12月 18 日上午9:30-11:30
    地点:广州天河区龙口东路龙口科技大厦3楼会议室,联系电话:020-29842086

    注:本次培训不收费,建议学员自带笔记本电脑,以便现场操作、互动练习。

请将报名信息直接发送到wg@gzbio.org

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